微孔濾膜操作有死端過濾(垂直流過濾)和錯流過濾(切線流過濾)。但是不論哪種操作都是有注意事項的：
① 用作起泡點的測定:測定起泡點壓力可以反映微孔濾膜的孔徑大小,這與被濾過的藥液質量密切相關,也是保證微孔濾膜質量的一種重要手段。使用的微孔濾膜應事先放在70℃左右的注射用水中浸泡1 h。將水傾出后再用溫注射用水浸泡過夜備用。臨用時取出,用注射用水淋洗干凈,即可裝入過濾器中使用,安裝。時防止濾膜裝歪泄漏。
② 為保護延長濾膜的使用壽命,可用同等大小的濾紙或絹綢布(應先用質量濃度20 g·L - 1磺酸鈉溶液煮沸絹綢布約30 min,然后用注射用水清洗干凈)放在濾膜上,防止濾膜破裂。
③ 微孔濾膜之孔徑為錐體狀,光滑的一面孔徑小為正面;粗糙的一面孔徑大為反面,安裝時應將正面(光面)朝上，反面(暗面)朝下，,否則易被雜質阻塞孔徑,影響濾速。溫度低時,應將處理好的濾膜放于與藥液溫度相同的注射用水中浸泡5~10 min,可避免因溫差使濾膜抗拉強度降低而導致破裂現象。
④ 在濾器架的排氣管的皮管頭上,固定一個16號輸液針頭,用止水夾控制,可避免排氣壓力與速度過大致使濾膜破裂。
⑤ 不要將濾架連同濾膜一起進行滅菌,否則濾膜因熱脹冷縮而致脆裂皺折。
⑥ 使用后,微孔濾膜放在注射用水中,防止干燥,但不要浸泡太久,對已失水干燥的微孔濾膜不能使用。
⑦ 根據藥液的濃度與粘度大小,應選用不同孔徑的微孔濾膜。
⑧ 若發現微孔濾膜有小洞孔或小裂縫時,可用原不用的破濾膜漂洗干凈后烘干,然后撕碎放于少量丙酮的小杯中,攪拌成糊狀粘液,將此粘液滴于平放濾膜的小洞孔或小裂縫處,不宜過多,粘液覆蓋而稍大即可,揮干后則可繼續使用而不影響。
⑨ 輸液過濾時先用粗濾后精濾的多級濾過裝置時,可用微孔濾膜作最后的精濾,宜采用加壓、減壓、方位靜壓濾方式。
